Fue fundado en 1949 por un grupo de trabajadores del Lloyd Aéreo Boliviano, con la finalidad de tener un equipo local que represente a la empresa, inicialmente nació con el nombre de San José de la Banda, con los colores Celeste y Blanco. Posteriormente se cambió el nombre del club a Jorge Wilstermann en homenaje al primer piloto comercial de Bolivia.

Los colores del club fueron cambiados en la gestión del Dr. Jorge Rojas Tardío, quien sugirió los colores actuales de la institución, "Escogí esos colores porque significan fuerza, garra y entrega total en el campo de juego, además era el único equipo en el país que entonces comenzó a usar esos colores" explica el ex-presidente de Wilstermann.

Uniforme

• Uniforme títular: Camiseta roja, pantalón azul, medias blancas.
• Uniforme alternativo: Camiseta verde fosforecente con vivos rojos, pantalón azul, medias blancas.

El color de la camiseta alterna es una propuesta de marketing entre el Club y la empresa de telecomunicaciones "VIVA" uno de los principales sponsors.

Escudo

El escudo porta 5 estrellas que representan la calidad del equipo, actualmente pueden verse escudos que portan 10 estrellas, estas representan los 10 títulos nacionales del Club.

Estadio

Ubicado en la zona de Cala Cala, una de las principales zonas de la ciudad de Cochabamba. capacidad aproximada de 32.000 espectadores. En este estadio se jugó la final de la Copa América 1963 en la que Bolivia se consagró campeón.

Principales logros

• Es el primer equipo boliviano en participar de la Copa Libertadores de América, a principios de la década de los 60 del siglo pasado.
• Unico club boliviano que se consagró Tri-campeón Nacional 1958-1959-1960.
• Primer y único equipo boliviano que clasificó a cuartos de final de la Copa Conmebol el año 1998 (antecesora de la Copa Sudamericana).
• Wilstermann ha logrado a lo largo de su historia contar con valiosos jugadores, destacándose en 1980-1981 la presencia en su plantilla del mundialista brasileño Jairzinho, quien pese a su veteranía, pudo dar muestras de su gran clase en las filas del cuadro "aviador".
• El año más importante fue en 1981, cuando el "piloto" Jairzinho y su navegante Gastón Taborga, llevaban por primera vez a un equipo boliviano a la semifinal de la Copa Libertadores de América, dejaron en el camino a Barcelona y Técnico Universitario de Ecuador, y a The Strongest, de La Paz, en la fase final, Flamengo, plagado de figuras, lo elimina
• Otros jugadores emblemáticos en la historia de este club: Renán Lopez, Ausberto García, Limberg Cabrera, Milthon Joana, Victor H. Bravo, J.A. Gangas, Victor E. Villalón, Gastón Taborga, Sergio Luna, Julio César Baldivieso, Erwin Romero, Norberto Kekes, Gonzalo Galindo, Mauricio Soria, Marcelo Carballo, Pedro Guiberguis, Vladimir Marín, Thiago Leitao, Hugo Suárez, Edgar Olivares, Daniel Juárez, Ricardo Pedriel.
• Es uno de los tres equipos bolivianos que jamás ha descendido de la primera categoría de su Asociación o de la Liga Profesional.
• Es el equipo con mayor hinchada en la ciudad de Cochabamba.
• Es el equipo que logro el campeonato de la liga profesional de Bolivia el año 2000, por ese motivo fue considerado el "Campeón del Milenio".